目前多按肛管與括約肌的關(guān)系將肛瘺分為4類。

1、括約肌間肛瘺　多為低位肛瘺，最常見，約占70%，為肛管周圍膿腫的后果。瘺管只穿過內(nèi)括約肌，外口常只有一個(gè)，距肛緣較近，約3～5cm。少數(shù)瘺管向上，在直腸環(huán)肌和縱肌之間形成盲端或穿入直腸形成高位括約肌間瘺。

2、經(jīng)括約肌肛瘺　可以為低位或高位肛瘺，約占25%，為坐骨直腸窩膿腫的后果。瘺管穿過內(nèi)括約肌、外括約肌淺部和深部之間，外口常有數(shù)個(gè)，并有支管互相溝通。外口距肛緣較近，約5cm左右，少數(shù)瘺管向上穿過肛提肌到直腸旁結(jié)締組織內(nèi)，形成骨盆直腸瘺。 　　

3、括約肌上肛瘺　為高位肛瘺，少見，占5%。瘺管向上穿過肛提肌，然后向下至坐骨直腸窩穿透皮膚。由于瘺管常累及肛管直腸環(huán)，故治療較困難，常需分期手術(shù)。

4、括約肌外肛瘺　最少見，占1%，為骨盆直腸膿腫合并坐骨直腸窩膿腫的后果。瘺管穿過肛提肌直接與直腸相通。這種肛瘺常由于克隆病、腸癌或外傷所致，治療要注意其原發(fā)病灶。以上分類在高低位方面較細(xì)致，有利于手術(shù)方法的選擇。

如肛管左右側(cè)均有外口，應(yīng)考慮為“蹄鐵型”肛瘺。這是一種特殊型的貫通括約肌肛瘺，也是一種高位彎型肛瘺，瘺管圍繞肛管，由一側(cè)坐骨直腸窩通到對側(cè)，成為半環(huán)型，如蹄鐵狀故名。在齒線附近有一內(nèi)口，而外口數(shù)目可多個(gè)，分散在肛門左右兩側(cè)，其中有許多支管，向周圍蔓延。蹄鐵型肛瘺又分為前蹄鐵型和后蹄鐵型兩種。后者多見，因肛管后部組織比前部疏松，感染容易蔓延。

檢查：外口呈乳頭狀突起或肉芽組織的隆起，壓之有少量膿液流出，低位肛瘺常只有一個(gè)外口，若瘺管位置較淺，可在皮下摸到一硬索條，自外口通向肛管。高位肛瘺位置常較深，不易摸到瘺管，但外口常有多個(gè)。由于分泌物的刺激，肛周皮膚常增厚及發(fā)紅。