慢性沙眼可反復(fù)感染，病程遷延數(shù)年至十多年。充血程度雖減輕，但與皮下組織有彌漫性細(xì)胞浸潤，結(jié)膜顯污穢肥厚，同時(shí)有乳頭增生及濾泡形成，濾泡大小不等，可顯膠樣，病變以上穹隆及瞼板上緣結(jié)膜顯著。同樣病變亦見于下瞼結(jié)膜及下穹隆結(jié)膜，嚴(yán)重者甚至可侵及半月皺壁。

    在慢性病程中，結(jié)膜的病變逐漸為結(jié)締組織所取代，形成瘢痕。最早出現(xiàn)在上瞼結(jié)膜的瞼板下溝處，呈水平白色條紋，以后逐漸呈網(wǎng)狀，待活動(dòng)性病變完全消退，病變結(jié)膜全部成為白色平滑的瘢痕。

    沙眼的病程和預(yù)后，因感染輕重與是否反復(fù)感染有所不同。輕者或無反復(fù)感染者，數(shù)月可愈，結(jié)膜遺留薄瘢或無明顯瘢痕。反復(fù)感染的重癥病人，病程可纏綿數(shù)年至十多年，慢性病種中，可由其他細(xì)菌感染和重復(fù)感染時(shí)則常呈急性發(fā)作。最后廣泛結(jié)瘢不再具有傳染性，但有嚴(yán)重的并發(fā)癥和后遺癥，常使視力減退，甚至失明。